Ο Παναθηναϊκός ξεκινά το ταξίδι του στα νοκ-άουτ του Conference League από τη Βίκινγκουρ της Ισλανδίας. Η πρώτη αναμέτρηση έχει προγραμματιστεί για τις 13 Φεβρουαρίου ενώ η ρεβάνς θα διεξαχθεί στις 20 Φεβρουαρίου.
Σε περίπτωση πρόκρισης στους 16, ο Παναθηναϊκός θα αντιμετωπίσει την Φιορεντίνα ή την Ραπίντ. Αν περάσει και από αυτό το εμπόδιο, στα προημιτελικά θα βρει απέναντι τους νικητές από τα ζευγάρια ΑΠΟΕΛ – Τσέλιε vs Τζουγκάρντεν ή Λουγκάνο.
Το μεγάλο φαβορί για να φτάσει στα ημιτελικά και να αντιμετωπίσει τον Παναθηναϊκό είναι η Τσέλσι. Αν οι δύο ομάδες συναντηθούν σε αυτό το σημείο, αναμένεται ένα ενδιαφέρον νοκ-άουτ παιχνίδι.
Ο τελικός του Conference League έχει οριστεί για τις 28 Μαΐου στο Βρότσλαβ της Πολωνίας, με τον Παναθηναϊκό να ελπίζει να φτάσει μέχρι το τέλος του τρόπαιου με εντυπωσιακές εμφανίσεις και αποτελέσματα.