Η χρήση του φυτού ύσσωπου αποδείχθηκε πολύτιμη για την αντιμετώπιση προβλημάτων πεπτικού και εντερικού συστήματος, καθώς και για την αντιμετώπιση διαφόρων παθήσεων όπως αυτές του ήπατος, της χοληδόχου κύστης, των περιπτώσεων εντερικού πόνου, των εντερικών αερίων, των κολικών και της απώλειας όρεξης. Επιπλέον, έχει εφαρμογές και στην αντιμετώπιση προβλημάτων αναπνευστικού συστήματος, όπως ο βήχας, το κοινό κρυολόγημα, οι λοιμώξεις του αναπνευστικού, ο πονόλαιμος και το άσθμα.
Το ύσσωπο χρησιμοποιείται επίσης για τη θεραπεία προβλημάτων του ουροποιητικού συστήματος, κακής κυκλοφορίας, αλλά και σε περιπτώσεις HIV/AIDS και κραμπών της περιόδου.
Ενδεικτικές χρήσεις περιλαμβάνουν την αντιμετώπιση προβλημάτων αερίων και κολικών, την ανακούφιση από τον πόνο του πονόλαιμου και τη βελτίωση της κυκλοφορίας. Επιπλέον, έχει αναφερθεί η χρήση του σε περιπτώσεις δερματικών προβλημάτων, όπως μώλωπες, εξανθήματα, εγκαύματα και κρυοπαγήματα.
Εκτός από τη χρήση του ως θεραπευτικό φυτό, το ύσσωπο μπορεί να χρησιμοποιηθεί και στη διατροφή. Το έλαιο και το εκχύλισμα του ύσσωπου χρησιμοποιούνται ως αρωματικά συστατικά σε διάφορες τροφές. Επίσης, στην κατασκευή καλλυντικών και σαπουνιών, το έλαιο του ύσσωπου χρησιμοποιείται για τη δημιουργία αρωματικών προϊόντων.
Ωστόσο, όπως κάθε φυτικό προϊόν, ο ύσσωπος πρέπει να χρησιμοποιείται με προσοχή. Ενδέχεται να προκαλέσει παρενέργειες σε ορισμένες περιπτώσεις. Για παράδειγμα, έχει αναφερθεί ότι το λάδι του ύσσωπου μπορεί να προκαλέσει επιληπτικές κρίσεις σε ορισμένα άτομα. Επιπλέον, δεν είναι σαφές αν είναι ασφαλές να χρησιμοποιείται κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης ή του θηλασμού. Ειδικές προφυλάξεις πρέπει να λαμβάνονται, ειδικά σε περιπτώσεις ατόμων με ιστορικό επιληπτικών κρίσεων.
Τέλος, όσον αφορά τη δοσολογία, η κατάλληλη ποσότητα ύσσωπου πρέπει να καθορίζεται με βάση πολλούς παράγοντες, όπως η ηλικία και η γενική υγεία του ατόμου. Είναι σημαντικό να ακολουθούνται οι οδηγίες που αναγράφονται στις ετικέτες των προϊόντων και οι ενδιαφερόμενοι να συμβουλεύονται επαγγελματίες υγείας πριν από τη χρήση.